Илья родился в городе Ухта Коми АССР.
В 1970 году семья Скрипниковых переехала в Ногинск. Сын пошел учиться в школу № 2 им. Короленко, параллельно увлекался борьбой дзюдо. После окончания десяти классов работал электромонтажником.
В 1980 году был призван в ряды Советской армии. После года службы в армии поступил в Саратовское высшее летное вертолетное училище (Саратовское ВВАУЛ).
По окончании учебы в ВВАУЛ был направлен в Республику Афганистан. Афганская командировка Ильи продолжалась год.
В 1996 - 1997 годах принимал участие в составе миротворческих сил в Республике Таджикистан, а также в Приднестровской Молдавской Республике с октября по декабрь 1992 года. В 1998 году его направляют служить в город Тулу.
Через год Илью направляют в Чеченскую республику. До конца командировки оставался месяц, когда майора Скрипникова направили на боевое задание в Аргунское ущелье. При пролете над вражеской территорией его вертолет МИ-8 попал под шквальный огонь противника. Понимая, что спастись не удастся, направил горящую машину в группу боевиков...
Командиру экипажа майору Скрипникову посмертно присвоено звание Герой России.